薄膜太阳能电池，有重金属问题
目前超过 90% 的太阳能电池使用多晶矽，然而近几年多晶矽材料出现短缺，使得部分业者转向投入薄膜太阳能电池，它的优势在於制造成本更低，使用的能源与材料更少，未来若转换率能进一步提升，有望与多晶矽相匹敌。除了上述的优点，薄膜太阳能电池可在价格低廉的玻璃、塑胶或不锈钢基板上蒸镀非晶矽薄膜，而不需从矽晶棒切割而来，因此产生的废弃物较少，也无须使用复杂的电弧炉，但这不代表薄膜太阳能电池不会造成环境污染。
薄膜太阳能电池的主要技术以非晶矽（a-Si）太阳能电池为最大宗，碲化镉（CdTe）太阳电池产量成长最快，铜铟镓硒（CIGS）太阳能电池则深具成长潜力，其中碲化镉太阳电池由五层结构组成，其中一层为硫化镉（CdS），另一层为碲化镉（CdTe）；铜铟镓硒（CIGS）太阳能电池主要材料为铜铟镓硒，但也含有硫化镉，这两种电池都使用重金属镉的化合物，它是恶名昭彰的致癌物质，长期暴露可能导致肾脏疾病、肺损伤与骨骼脆弱。
一些制造商如总部设在亚利桑纳州的 First Solar（第一太阳能），对於工人的安全维护措施就做得很完善，但对那些从事开采或提炼等早期阶段的工人，相关的安全讯息就很少；另外弃置的太阳能电池也是问题，若没有妥善的回收机制，会增加镉暴露的风险，对此许多大厂都做的不错，如 First Solar 的预付回收系统（prefunded take-back system），但回收计画并没有提供给全部的使用者，甚至许多人根本没意识到太阳能电池需要回收。
减少镉危害的方式就是尽量使用无镉产品。目前有两个铜铟镓硒制造商 Avancis 和 Solar Frontier，以对环境较友善的材料硫化锌取代硫化镉；英国布里斯托大学（University of Bristol）和巴斯大学（University of Bath）、加州柏克莱大学也正尝试发展薄膜太阳能电池，另外 First Solar 也逐渐减少镉在太阳能电池的使用量。
能源回收要多久？
有毒并非是唯一的问题，制造太阳能需要大量的能源，幸运的是，因为电池能生产电力，可回收原本投资的能源，大部分的电池运作两年後就可以打平，有些电池甚至能缩短至半年，但能源回收与资金回收的时程不能混为一谈，两者有时间差距。
除了能源回收是否符合效益，碳足迹也是个问题，通常以碳排放强度（carbon-intensity）为计算单位，也就是生产每千瓦小时的能量会排放多少公斤的二氧化碳，其中较依赖煤炭供电的碳排放强度最高，例如中国，电力生产的碳排放强度是美国的两倍，这个数据与阿贡国家实验室（Argonne National Laboratory）和西北大学（Northwestern University）在 2013 年发表的报告相似，报告指出中国制造的太阳能板其碳足迹是欧洲制造的两倍。
▲ 中国制造的太阳能板其碳足迹是欧洲制造的两倍
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