其中，分布式光伏发电系统自用有余上网的电量，由电网企业按照当地燃煤机组标杆上网电价收购。对分布式光伏发电系统自用电量免收随电价征收的各类基金和附加，以及系统备用容量费和其他相关并网服务费。国家根据光伏发电发展规模、发电成本变化情况等因素，逐步调减光伏电站标杆上网电价和分布式光伏发电电价补贴标准，以促进科技进步，降低成本，提高光伏发电市场竞争力。鼓励通过招标等竞争方式确定分布式光伏发电电价补贴标准，但通过竞争方式形成的电价补贴标准不得高于国家规定的电价补贴标准。
财政部《关于分布式光伏发电实行按照电量补贴政策等有关问题的通知》（以下简称财建[2013]390号）明确，国家补贴资金通过电网企业转付给分布式光伏发电项目单位，并规范了资金拨付流程：中央财政根据可再生能源电价附加收入及分布式光伏发电项目预计发电量，按季向国家电网公司、南方电网公司及地方独立电网企业所在省级财政部门预拨补贴资金。电网企业根据项目发电量和国家确定的补贴标准，按电费结算周期及时支付补贴资金。具体支付办法由国家电网公司、南方电网公司、地方独立电网企业制定。
国家电网公司和南方电网公司具体支付办法报财政部备案，地方独立电网企业具体支付办法报省级财政部门备案。年度终了后1个月内，国家电网公司、南方电网公司对经营范围内的项目上年度补贴资金进行清算，经省级财政、价格、能源主管部门审核同意后报财政部、国家发展改革委、国家能源局。地方独立电网企业对经营范围内的项目上年度补贴资金进行清算，由省级财政部门会同价格、能源主管部门核报财政部、国家发展改革委、国家能源局。财政部会同国家发展改革委、国家能源局审核清算。
国能新能[2014]406号文结合发展过程中的实际难题，对分布式光伏发电的电费结算和补贴拨付进行了补充完善。
一是各电网企业按月（或双方约定）与分布式光伏发电项目单位（含个人）结算电费和转付国家补贴资金，要做好分布式光伏发电的发电量预测，按分布式光伏发电项目优先原则做好补贴资金使用预算和计划，保障分布式光伏发电项目的国家补贴资金及时足额转付到位。
二是电网企业应按照有关规定配合当地税务部门处理好购买分布式光伏发电项目电力产品发票开具和税款征收问题。
三是对已备案且符合年度规模管理的项目，电网企业应做好项目电费结算和补贴发放情况的统计，并按要求向国家和省级能源主管部门及国家能源局派出机构报送相关信息。
四是项目并网验收后，电网企业代理按季度向财政部和国家能源局上报项目补贴资格申请。
从理论分析，只要严格执行国家发展改革委、财政部和国家能源局相继出台的上述政策文件，就能够较好地解决电费回收和电价补贴到位的问题。但在实际执行过程中，却反映出两大难题并没有得到较好解决。分析原因：
其一，分布式光伏发电发展时间不长，新做法涉及众多政府部门和环节，需要一定时间来调整完善各类配套政策和理顺工作流程，发展初期出现这些问题是正常的。
其二，国家财政补贴资金总量有缺口，中央财政根据可再生能源电价附加收入及分布式光伏发电项目预计发电量，难以足额按季向国家电网公司、南方电网公司及地方独立电网企业所在省级财政部门预拨补贴资金。电网企业也因此难以根据项目发电量和国家确定的补贴标准，按电费结算周期及时足额支付补贴资金。这就需要坚持发展规模与财政补贴能力直接挂钩的原则，量财力而定发展规模。
其三，国家补贴资金拨付流程尚待优化，需要更加发挥电网企业作用，强化统筹规划和部际联席项目核准制，增强信息透明度，充分利用互联网来缩短审核时间，加快拨付节奏。
其四，全面推行电网企业电费收取委托制。在分布式光伏发电发展初期，国家明确委托电网企业负责为分布式光伏发电项目无偿提供电费收取、补贴申领等服务，为此发生的相关成本应统一从可再生能源电价附加中支付，或列入独立输配电价中的输配电网准许成本予以回收。
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