补贴机制的片面性问题
目前，光伏发电的补贴方式主要为度(千瓦时)电补贴或装机补贴，补贴对象主要为电站业主方，但对配套端如电网、调峰电源等的补贴机制则有所欠缺。以电网公司为例，其收入主要来自发电环节与终端销售环节之间的“价差”，因此对于电这种商品而言，如果质量好，价格适合，电网公司肯定乐于接纳。但一方面由于光伏电力具有波动性、间歇性和随机性等特点，光伏电力可能会给电网带来一定冲击;另一方面光伏电力的使用可能导致电网公司售电量的减少，但光伏电力并网工程的建设和维护却全部需要电网公司负责，补贴却没有考虑到电网公司。担着风险，还要倒贴钱，因此电网公司积极性自然不高。同理，对于调峰电源而言，由于为光伏电站调峰，使其发电利用小时数减少，出力减少，其自然有怨言。大规模发展光伏还将可能影响到其他常规电源如火电和水电的经济利益。因此，大规模发展光伏电站，需从整个电力系统进行统筹，补贴机制的出台应该做到能对电网、调峰电源建设等均起到促进作用。
光伏发电经济性问题
光伏产品的最终用途是发电，其发展潜力不言而喻。但由于目前光伏发电尚不具备经济性，其发电成本约为同为可再生能源的水电的4倍、风电的2倍。以今年的补贴电价为例，大型光伏电站的电价为1元/千瓦时，风电的收购价格约为0.5元/千瓦时，按当地脱硫标杆电价0.35元/千瓦时计，则光伏电力的可再生能源补贴约为0.65元/千瓦时，而风电的补贴为0.15元/千瓦时。从单位资金补贴可再生能源电量最大化的角度而言，大力发展光伏发电的经济性有待提高。此外，从光伏电站投资看，目前系统平均投资约为11元/瓦，组件之外的电气、施工、调试等成本占据近60%。这些成本主要与原材料、人力等有关，多为刚性，下降空间较小，因此即使组件价格下降为零，光伏电站初始投资成本仍将在6元/瓦，发电成本仍将在0.5元/千瓦时以上。光伏发电的平价上网(不再依赖补贴)预期，除了需要电池组件等成本持续下降外，还需要依赖传统能源使用价格的提高，过程较为缓慢，因此发电经济性问题的解决不可能一蹴而就。但我们应看到，东南沿海地区高峰时段的用电价格已高达1元/千瓦时以上，如果在这些地区推广分布式发电，鼓励自发自用、余电上网，无疑可极大缓解光伏发电的经济性问题，因此光伏发电的应用还应考虑到从何处切入，以提高其经济性。
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