据不完全统计，2009年全国可再生能源电价附加补贴缺口为13亿元，2010年缺口20亿元，到2011年缺口已达100多亿。
按照电监会价格与财务监管部副主任黄少中的说法，在电费结算时，电网企业也存在变相减少新能源企业发电量、压低上网电价的问题;加上各省的补贴资金调配时间差，导致新能源发电企业往往需要半年至一年才能拿到补贴。
不过，国家能源局可再生能源司司长梁志鹏则坦言，过去电价附加一直被作为电网企业收入的一部分，一些地方对电价附加征收所得税，“导致电价附加资金大幅缩水，估计三分之一的资金被上缴财政”，由此造成大量欠账。
而欠账背后则是新能源成长的增速。电监会数据显示，1-9月可再生能源上网电量同增27.2%;我国新能源的发展目标是：风电2015年装机1亿千瓦，较之目前翻一倍;光伏2015年装机2100万千瓦，较之目前增长7倍。
基于以上考虑，2012年可再生能源电价附加从由每千瓦时4厘提高至8厘，而在2009年11月份以前该电价附加是2厘。提高后，可使今年可再生能源基金规模达到340亿元。
“可再生能源电价附加提高之后，340亿足够支付2015年之前的现有项目及新增项目。”刘文平说，风电每年新增2000多万千瓦，每年新增补贴50亿元左右;2011年光伏装机3GW，每年发电四十亿度左右，一度补贴0.6元，约20亿元补贴，所占容量不大，“由于补贴盘子的扩大，明年会迎来光伏电站的收购潮”。
国务院研究室综合司副司长范必认为，充分发掘现有政策潜力，取消各地自行出台的可再生能源电价附加减免政策，加强征收和使用各环节的管理，做到应收尽收。仅此一项一年可增加可再生能源基金近200亿元。
刘应宽还建议，目前电价中仍有三峡基金等构成，而三峡已经建成，“可以将这部分费用部分应用于发展清洁能源”。
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