根据用户用电量或者期望待机时间确定蓄电池容量。
蓄电池的任务是在太阳能辐射量不足时，保证系统负载的正常用电。对于重要的负载，要能在几天内保证系统的正常工作，要考虑连续阴雨天数。对于一般的负载如太阳能路灯等可根据经验或需要在2～3天内选取。重要的负载如通信、导航、医院救治等则在3～7天内选取。另外还要考虑光伏发电系统的安装地点，如果在偏远的地方，蓄电池容量要设计得较大，因为维护人员到达现场就需要很长时间。实际应用中，有的移动通信基站由于山高路远，去一次很不方便，除了配置正常蓄电池组外，还要配备一组备用蓄电池组，对于一般贫困家庭而言，主要考虑价格，则不用考虑阴雨天，太阳好的时候多用。太阳不好的时候少用，没有太阳则不用。选择负载时，尽量使用节能设备，如LED灯，变频空调。蓄电池的设计主要包括蓄电池容量的设计计算和蓄电池组串并联组合的设计。
在光伏发电系统中，大部分使用的都是铅酸蓄电池，考虑到电池的寿命，一般取放电深度为0.5-0.7之间。蓄电池设计容量=(负载日均用电量*连续阴雨天数)/蓄电池放电深度。
蓄电池的充电电流一般为0.1C-0.2C，最大不超过0.3C，例如1节铅酸蓄电池12V200AH，充电电流一般在20A到40A之间，最大不能超过60A;蓄电池的放电电流一般为0.2C-0.5C，最大不超过1C，1节12V200AH铅酸蓄电池，输出最大功率不超过2400W，不同的厂家，不同的型号，具体的数值也不一样，设计时要向厂家索取说明书。
