即使条件适应的屋顶找到了，建设方和业主在合作方上又经常发生分歧。由于信任度不够，屋顶业主担心建设单位的工程质量，建设方则担心业主缴费困难、建筑物是否有持续性，加之项目收益分配众口难调，项目建设往往难以启动。
除了屋顶安装难题，企业融资也遇到不小阻碍。2013年，辽宁省锦州市决定由沈阳西东控制集团承建20兆瓦城市分布式光伏示范项目，总投资需要1.8亿元，其中建设单位自筹2000万元，业主单位和合作企业筹集4000万元，还需贷款1.2亿元。而银行由于建设单位授信额度和对项目长期收益风险的问题拒绝贷款。
此外，吴胜丰透露，目前个别市县电网接入周期仍偏长，并网手续繁琐。光伏发电投资方提出的光伏发电就近消纳要求很难执行，很大程度上限制了分布式光伏发电项目推进。
纯依赖政策难以为继
“在我国发展分布式太阳能还有难度，关键在政府要主动作为，敢于担当；企业要主动发展，解决问题；金融机构、电网等关联企业也要密切配合。”吴新雄一句话为分布式光伏发展指明了方向。
推进分布式解决屋顶资源缺乏问题首当其冲。浙江省坚持限制性要求和激励推进相结合，明确用能大户和屋顶面积大的企业参与光伏发电的责任义务，并要求新建厂房需预留安装光伏发电空间。比如，浙江嘉兴市规定对新增建筑屋顶面积达到1000平方米以上的工商业和公共建筑、新建年综合能耗超过3000吨标准煤的企业和屋顶面积达5000平方米以上的工业企业，按照光伏建筑一体化的标准同步设计、同步建设屋顶光伏电站。
虽然目前国家对光伏产业给予大力支持，但任何一个产业，单纯依赖政策难以长久为继。必须创立商业化的运作模式，让光伏产业得以持续健康的发展。
广东佛山三水工业园区经济发展局局长吴成贵介绍说，三水在解决光伏电站建设融资问题上，积极探索了金融创新的模式，在电站建设过程中引入金融和保险机构，通过金融平台和保险产品，让一个个发电项目变成一个个资本市场运作的项目。在三水工业园区，130兆瓦项目必须购买国内保险公司提供的25年光伏组件质量险和逆变器质量险。与此同时，光伏电站发电量损失险初步方案已经确定。金融机构可以通过发电量损失险确保光伏电站质量，同时该险种可以在电站运营期间，对电站年发电量或银行贷款的安全性进行保险，当电站发电收益不能覆盖银行贷款时，由保险公司进行补偿。
“体制问题，实际上是政府支持模式创新问题。除了政策支持，我们从管理、并网、运维全方位加以支持。通过引进专门的光伏云公司等专业第三方，负责分布式光伏电站的融资、总成、营运、安全、计量、信息等服务，有效解除了投资方、屋顶业主的后顾之忧。”嘉兴市市长肖培生说。
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