然而，从企业反映的情况来看，内蒙古太阳能光伏产业虽然取得了不错的成绩，但仍然存在产业链不完整、企业融资难、税费负担重、并网和补贴手续复杂难办等问题,如果不加以重视和解决，我区打造中国光伏产业基地的蓝图很有可能化为泡影。
产业两头大，中间小
光伏产业是一个从硅材料、硅棒、硅片、太阳能电池、组件到电站应用的一个产业链。我区光伏产业发展主要集中在两部分，一部分是以硅材料生产为主，如神州硅业、国电晶阳、锋威新能源、盾安光伏、包头三晟、晟纳吉、中环光伏材料有限公司等公司，基本都是以生产多晶硅或单晶硅为主；第二部分是以光伏电站建设为主的终端应用，像内蒙古大友、内蒙古香岛、神州光伏、中环能源（内蒙古）有限公司、盾安光电以及国内央企新能源行业的五大四小等，几乎都在内蒙古建有光伏电站。
目前，我区光伏产业发展已经有相当大的规模。国内目前在产的多晶硅企业不到20家，内蒙古就占了5家，年产能22000吨左右。同时还有晟纳吉、中环、日月等生产单晶硅棒、切片的企业。电站建设发展也很快，截至2014年底，我区累计光伏装机达3000兆瓦，成为我国五大光伏装机大省之一。特别是光伏发电和现代农牧业、蔬菜大棚、农村扶贫相结合的模式，有效地提高了土地利用水平和老百姓的收入。
从整个产业链来看，我区光伏产业发展中最缺的就是组件生产企业和逆变器企业。目前为止，我区还没有一家生产组件和逆变器的企业。所以说，未来，如果能够把国内组件企业和逆变器企业引进来，那么自治区的光伏产业链就比较完善了。
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